Beberapa program unggulan dari SMP Sains Cahaya Al-Qur’an
1. Menerapkan 3 kurikulum sekaligus (kurikulum adaptif), yaitu:
– Kurikulum Integrasi Sains dan Al-Qur’an
– Kurikulum Nasional
– Kurikulum Kearifan Pesantren
2. Mengedepankan kegiatan pembelajaran dengan pemahaman ayat-ayat kauniyah yang bersumber dari Al-Qur’an dan Al-Hadist
3. Memiliki program matrikulasi : Bahasa Arab, Matematika, Bahasa Inggris, IPA